Diapositiva 1 - Università di Bologna

Alma Mater Studiorum – Università di Bologna
DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE FaBiT
Laboratorio di Biologia Molecolare
Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria
Dario de Biase
Tutor Prof.ssa Annalisa Pession
Bologna, 09 Giugno 2015
DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT
Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Diagnostica Molecolare
Di cosa ci occupiamo?
Caratterizzazione molecolare di neoplasie solide
Da cosa partiamo?
Analizziamo il DNA da:
- tessuti freschi (resezioni chirurgiche/biopsie)
- tessuti FFPE (resezioni chirurgiche/biopsie)
- campioni citologici (diretti/strisci su vetrino)
Cosa analizziamo?
Markers
molecolari
Diagnostici
Prognostici
Predittivi
Principali indagini di diagnostica molecolare
DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT
Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Indicazione
Tessuto
Lesione
Markers
Terapeutica
Clinica
EGFR
KRAS
S/R
R
Erlotinib/
Gefitinib
-
EML-ALK
S
Crizotinib
-
KRAS
NRAS
R
R
BRAF
-
-
Prognostico neg.
Neoplasie gliali
MGMT
IDH1-2
S
-
Temozolomide
-
Prognostico pos.
Ca. papillifero-follicolare
BRAF-RAS
R
Radioiodio
Diagnostico
Ca. midollare
RET
S
Vandatenib
Diagnostico
Cute
Melanoma
BRAF
S
S
Vemurafenib
Dabrafenib
-
Pancreas
Lesioni maligne/
Adenocarcinoma
KRAS
-
-
Diagnostico
Lesioni anogenitali
Condiloma
HPV-typing
-
-
Polmone
Colon
Cervello
NSCLC
Adenocarcinoma
metastatico
Cetuximab/
Panitumumab
-
Tiroide
Incremento Rischio
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Progetti di ricerca - 1
Tumori Cerebrali
Analisi degli effetti del trattamento su una linea
cellulare di Medulloblastoma: analisi del miRNOMA
Ricerca di markers molecolari per fini prognosticipredittivi
Tumori tiroidei
Caratterizzazione molecolare, analisi mutazionale di
potenziali markers molecolari
DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT
Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Progetti di ricerca - 2
Sclerosi laterale amiotrofica
Isolamento, caratterizzazione e analisi miRNOMA di
pazienti SLA
Tumori Pancreatici
Profilo molecolare di carcinomi pancreatici lungo
sopravviventi
Tumori ipofisari
Ricerca di markers molecolari per diagnostica
differenziale di lesioni ipofisarie
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Tecniche - 1
Tecniche mutazione-specifiche
Es. Allele-specific PCR per le
mutazioni più frequenti di KRAS,
BRAF e IDH1
Real-Time ABI7000
High Resolution Melting (HRM)
Es. Screening mutato/non mutato
per KRAS e EGFR
Es. Campione KRAS G12D
Light Cycler 480 (Roche)
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Tecniche - 2
Sequenziamento Sanger
- si analizza tutta la regione di
interesse
- sensibilità 20%
Next Generation sequencing
- si analizza tutta la regione
di interesse
- sensibilità 1%
- parallel sequencing
- high-throughput
CEQ2000 XL
(Beckman Coulter)
Es. Campione KRAS G12D
454-GS Junior
(Roche)
Es. Campione KRAS G12D
Cosa NON facciamo
• Trasfezioni
• Colture cellulari
• Saggi enzimatici
• Studi in vivo
Requisiti
Tempo richiesto: almeno 9 mesi
Orario Lavorativo: dalle 9 alle 17, dal Lunedì al Venerdì
Tirocinio Assolto
Esami: finiti o massimo un paio mancanti
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Staff & Info
Chi siamo:
Prof.ssa Annalisa Pession
[email protected]
Dr.ssa Michela Visani PhD (Borsista)
[email protected]
Dr. Dario de Biase PhD (Borsista)
[email protected]
Dr.ssa Giorgia Acquaviva (Borsista)
[email protected]
Dove siamo:
Laboratorio di Biologia Molecolare
Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria
Via Altura 3, Bologna
Linea bus: 36, 90