EGI Task Force Membership - Istituto Nazionale di Fisica Nucleare

(Distributed Unified Computing for Knowledge)
Accordo di Collaborazione fra comunità scientifiche multidisciplinari per
problematiche e infrastrutture di calcolo distribuito in Emilia Romagna.
Introduzione e attivita’ del cnaf
CdC 3 dicembre 2010
Antonia Ghiselli
INFN-CNAF
Coordinatrice dell‘iniziativa duck
date
• Iniziativa nata a fine 2009 e promossa da Biocomp (Rita Casadio), INGV
(Nadia Pinardi e Antonio Navarra), INFN-CNAF (A.Ghiselli) e UNIFE
(Eleonora Luppi)
• Giugno 2010, ultima versione dell’accordo di collaborazione sottoposto
all’INFN, gia’ firmato da 8 partner e alla firma dell’ultimo partner
• Attivita’ iniziata a marzo 2010 con riunioni quasi-mensili
• 10 nov 2010, primo workshop
• Persone coinvolte finora :
– Grid-operation in modo rilevante: T.Ferrari, P.Veronesi, M.Bencivenni, D.Cesini
– Ricerca in modo saltuario: M.Cecchi, F.Giacomini
– Tier1 in modo saltuario: D.Salomoni
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abstract dell’accordo
•
Gli enti proponenti questo accordo, appartenenti a diverse discipline scientifiche, si
pongono l'obiettivo di creare un contesto di collaborazione e cooperazione per
risolvere problemi comuni di calcolo, identificare e/o potenziare servizi e strutture di
calcolo distribuito, ed eventualmente estendere le soluzioni ad altri settori della
Pubblica Amministrazione, Sanita' e a settori privati dell'Emilia Romagna.
•
Le attivita' di ricerca, sviluppo e implementazione prenderanno spunto dalle
applicazioni dei vari settori scientifici dei partner con l'obiettivo di identificare servizi
di comune interesse e realizzarli in collaborazione con altre strutture gia' esistenti in
ambito nazionale (per esempio IGI) o europeo (EGI...) oppure tramite progetti
comuni per bandi della Regione, del MIUR o europei.
•
Contemporaneamente i partner si impegnano a partecipare all'utilizzo e al
potenziamento delle infrastrutture esistenti di calcolo distribuito a livelo regionale.
•
Un comitato di coordinamento svolgera' l'attivita' di individuazione degli scenari
strategici in materia di calcolo, di realizzazione di infrastrutture, di formulazione di
programmi di ricerca e di trasferimento tecnologico.
•
L'accordo ha la durata di quattro anni rinnovabili.
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Il Comitato di Coordinamento
svolge le seguenti funzioni:
a) individuare scenari strategici nel settore della ricerca sulle
tematiche del calcolo distribuito per lo sviluppo di sinergie
comuni;
b) proporre programmi di ricerca, di realizzazione di infrastrutture e
di trasferimento tecnologico nelle tematiche individuate nel
presente Accordo;
c) promuovere altri temi di interesse comuni diretti al
conseguimento degli scopi di cui al presente Accordo.
•
Il Comitato provvede a definire le modalità del proprio
funzionamento e nomina il Coordinatore Il Comitato si riunisce
con cadenza almeno trimestrale per esaminare le problematiche
e le conseguenti iniziative da intraprendere di volta in volta, da
inserire nei rispettivi programmi di attività e per constatare il
progresso di quelle già avviate.
I partecipanti
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l’Istituto Nazionale di Fisica Nucleare, con le sedi INFN-BO e INFN-CNAF
l’Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV), Sezione di Bologna
il Centro EuroMediterraneo per i Cambiamenti Climatici (CMCC), Sezione di Bologna
il Centro Interdipartimentale di Ricerca sul Cancro "GIORGIO PRODI" - Università di
Bologna
Bologna Computational Biology Network / Dipartimento di Biologia Evoluzionistica
Sperimentale dell'Università di Bologna,
CeIRG Centro Interdipartimentale di Ricerche Genomiche dell’Università di Modena e
Reggio Emilia,
l’Area di Ricerca del CNR di Bologna (CNR/INAF)
il Dipartimento di Fisica dell’Università di Ferrara
il Dipartimento di Fisica dell'Alma Mater Studiorum-Università di Bologna
La collaborazione e’ aperta.
Programma di attivita’ in corso
 Configurazione del sito www.comput-er.it (Bencivenni)
 Infrastruttura di calcolo distribuita (Veronesi, Bencivenni)
– setup di risorse di calcolo e storage
– Configurazione dei servizi Grid
 Applicazioni
– porting delle applicazioni sull’infrastruttura
• BioInformatica: Analisi del varioma umano (Bencivenni)
• BioMedicina: Analisi del varioma umano correlato a cancro
(Bencivenni)
• Scienze Marine: Modellistica Dorsali Oceaniche (Veronesi)
• Chimica computazionale: Studio di sistemi molecolari su GPU
(Salomoni, Cesini)
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Nuove esigenze
– Un servizio di metadati avanzato, comune a diversi domini
di dati scientifici, e disponibile a utenti esterni.
– Interfacce web di alto livello o portali per l’accesso al calcolo
e ai dati
– Ottimizzazione nell’uso dei multi-core e delle GPU
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Agenda con presentazioni sull’attività
svolta finora
09:10->09:30 Accordo di Collaborazione DUCK, Antonia Ghiselli (INFN - CNAF)
09:30->11:00 Servizi di calcolo distribuito per l'infrastruttura Comput-ER
-Servizi Grid per il calcolo e l’accesso ai dati, Francesco Giacomini (INFN - CNAF)
-Scientific Computing in the Cloud, Davide Salomoni (INFN - CNAF)
-Comput-ER, l'infrastruttura di calcolo distribuito in Emilia Romagna
Marco Bencivenni (INFN-CNAF) , Paolo Veronesi (INFN-CNAF)
11:00 Pausa Caffè
11:30->15::00 Applicazioni Scientifiche in Grid
11:30 Bioinformatica e Medicina Molecolare, Rita Casadio, Guido Biasco, Silvio Bicciato
12:15 Oceanografia Operativa e il calcolo distribuito, Nadia Pinardi
12:30 Modellazione 3-D di flussi del mantello litosferico in Dorsali oceaniche, Giovanni Bortoluzzi,Marco
Ligi
12:45 Applicazioni di chimica computazionale su GPU: studi su nanosistemi ibridi (biologici, organici
e inorganici) e proteine, Stefano Ottani, Alessandro Venturini
13:00 Pausa pranzo
14:00 Modelli di calcolo distribuito in HEP, Vincenzo Vagnoni, Eleonora Luppi
14:15 Calcolo distribuito in Radioastronomia, Mauro Nanni
14:30 Gestione di dati satellitari e simulati di evoluzione stellare, Giuliano Taffoni
14:45 Gestione avanzata di dati in grid per i cambiamenti climatici, Giovanni Aloisio
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Tavola Rotonda
Il workshop costituisce un'importante occasione di scambio con altri enti e settori di
ricerca, esponenti della Regione utile a valutare la possibilità di ulteriori sinergie,
impatto sul territorio e prospettive future.
"Infrastrutture per il calcolo Scientifico in Emilia Romagna: benefici, impatto sul
territorio e prospettive future".
Moderatore Antonio Zoccoli
Interverranno sull'aspetto "Benefici“
• Mariangela Ravaioli, presidente dell'Area di Ricerca di Bologna CNR/INAF, sui benefici
dell'iniziativa per il CNR/INAF (5-10min)
• Rita Casadio, coordinatrice del Biocomp Group, interverra' sul tema "Benefici di una
infrastruttura per il calcolo distribuito per l'analisi dei dati nell ' era postgenomica a fini biomedici" (5')
• Antonio Navarra, direttore del CMCC, ci parlera' dei benefici dell'iniziativa duck per il
CMCC/INGV (5')
• Mirco Mazzucato, coordinatore della Grid Italiana (IGI), interviene su "Prospettive
dell'infrastruttura di calcolo distribuita: IGI ed EGI" (10')
• Dario Braga, prorettore alla ricerca, sui benefici di una infrastruttura distribuita nell'ambito
universitario e del tecnopolo di UNIBO (5').
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Tavola Rotonda
Interverranno sull'aspetto "Impatto sul territorio e prospettive future":
•Paolo Bonaretti, direttore di Aster, ci parlera' delle iniziative della regione ER sul
trasferimento tecnologico ,
•Roberto Zamboni, CNR, responsabile tecnopolo CNR-AMBIMAT, fara' una
illustrazione del tecnopolo CNR AMBIMAT, come esempio di trasferimento
tecnologico ,
•Lucia Mazzoni, dell'Aster, referente per la tematica ICT nell'ambito dei tecnopoli,
farà il punto sui lavori della piattaforma ICTeDESIGN ,
•Sanzio Bassini, Direttore del Dipartimento Super Calcolo del CINECA, con un
intervento su: Il cineca e l'iniziativa duck, prospettive di collaborazione
•Gianluca Mazzini, direttore generale di Lepida, ci parlera' di Lepida
•Patrizio Bianchi , assessore universita' e ricerca, e Silvano Bertini,
responsabile servizio politiche di sviluppo economico, sui programmi della
Regione di interesse per l'iniziativa duck.
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