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21-Ciclo citrico 1

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21-Ciclo citrico 1
IL CICLO DELL’ACIDO
CITRICO
ciclo di Krebs
ciclo degli acidi tricarbossilici
1
2
3
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La stechiometria del ciclo dell’acido citrico
3 NAD + + FAD + GDP + Pi + acetilCoA →
+
→ 3 NADH + 3 H + FADH 2 + GTP + CoA + 2 CO 2
NADH, FADH2 e GTP immagazzinano l’energia libera resa
disponibile dall’ossidazione del gruppo acetile a 2CO2
5
Decarbossilazione ossidativa del piruvato
IL COMPLESSO DELLA PIRUVATO DEIDROGENASI: 4.6 MDa, 300 Å
6
Decarbossilazione ossidativa del piruvato: 5 reazioni distinte,
3 enzimi distinti, 5 coenzimi richiesti
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E1 : piruvato deidrogenasi
E2 : diidro-lipoil transacetilasi
E3 : diidro-lipoil deidrogenasi
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IL CORE (E2) del COMPLESSO DELLA PIRUVATO DEIDROGENASI
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E2
E1 + E3
E1 + E2 + E3
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Trimero a un vertice del cubo
Core cubico della E2 diidro-lipoil transacetilasi procariotica
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Core dodecaedrico della E2 diidro-lipoil transacetilasi eucariotica
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Reminder: fermentazione alcoolica
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E2
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Sito attivo di E3 diidro-lipoil deidrogenasi
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E2
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- NADH e Ac-CoA inattivano la PyrDH per competizione con i substrati
- NADH e Ac-CoA attivano la PyrDH-Kinasi, inibendo quindi la PyrDH
- Insulina (risposta ipoglicemizzante a livelli alti di glicemia) attiva la PyrDH-fosfatasi,
promuovendo quindi la completa ossidazione del piruvato a CO2
(e la immobilizzazione di glucosio in glicogeno, per altre vie).
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Il ciclo dell’acido citrico
• Ciclo di Krebs
• Ciclo degli acidi tricarbossilici
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Ac. BICARBOSSILICI
saturi, non-sostituiti
OSSALICO
MALONICO
SUCCINICO
GLUTARICO
2C
3C
4C
5C
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Ac. BICARBOSSILICI
saturi, non-sostituiti
OSSALICO
MALONICO
SUCCINICO
GLUTARICO
2C
3C
4C
5C
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(Anim_Figure 21-44)
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LO SHUTTLE MALATO/ASPARTATO
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La stechiometria del ciclo dell’acido citrico
+
3 NAD + FAD + GDP + Pi + acetilCoA →
+
→ 3 NADH + 3 H + FADH 2 + GTP + CoA + 2 CO 2
NADH, FADH2 e GTP immagazzinano l’energia libera resa
disponibile dall’ossidazione del gruppo acetile a 2CO2
Riduzione di 3 NAD+ Æ NADH + H+, a livello di:
ISOCITRATO DH, α-KETOGLUTARATO DH, MALATO DH
Riduzione di 1 FAD Æ FADH2 da parte di SUCCINATO DH
Produzione di 1 GTP a livello di SUCCINIL-CoA SINTETASI
NB: il tutto 2x se riferito ad 1 molecola di glucosio
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- Inibizione da prodotto
- disponibilita’ di substrati
- inbizione a feed-back
Anim_Figure 21-45
Cammini metabolici: Catabolici, Anabolici, Anfibolici -TCA e’ un ciclo anfibolico
Reazioni CATAPLEROTICHE – “svuotano” il ciclo da suoi componenti per
sintetizzarne altri altrove
Reazioni CATAPLEROTICHE – “svuotano” il ciclo da suoi componenti per
sintetizzarne altri altrove (es. aminazione riduttiva)
Reazioni CATAPLEROTICHE – “svuotano” il ciclo da suoi componenti per
sintetizzarne altri altrove (es. transaminazione)
Reazioni ANAPLEROTICHE – “riforniscono” il ciclo dei suoi componenti per
mantenere la produttivita’ energetica (es. transaminazioni di Asp e Glu)
Reazioni ANAPLEROTICHE – “riforniscono” il ciclo dei suoi componenti per
mantenere la produttivita’ energetica (es. piruvato carbossilasi)
Ciclo del GLIOSSILATO
(piante, funghi, batteri)
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+
2 Acetil CoA + 2 NAD + FAD →
→ ossalacetato + 2 CoA + 2 NADH + FADH 2 + 2 H +
+
2 Acetil CoA + NAD + 2 H 2 O →
→ succinato + 2 CoA + NADH + H +
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