sviluppato a Bolzano l`algoritmo che legge il DNA in tempi rapidissimi

Ricerca: sviluppato a Bolzano l'algoritmo che legge il DNA in tempi rapidissimi
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Ricerca: sviluppato a Bolzano
l’algoritmo che legge il DNA in
tempi rapidissimi
Il nuovo algoritmo trova applicazione sia nell’analisi delle cause
genetiche delle malattie, sia nella genetica delle popolazioni
4 maggio 2015 16:18 - F.F.
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METEO
+24h +48h +72h
E’ nato a Bolzano, da una collaborazione tra
EURAC e Universita’, un algoritmo matematico
che consente il riconoscimento di sequenze
regolari del DNA in un tempo rapidissimo: dai
http://www.meteoweb.eu/2015/05/ricerca-sviluppato-a-bolzano-lalgoritmo-che-legge-... 05/05/2015
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20 giorni di lavoro finora richiesti, il nuovo
metodo permette di scendere a 5 ore. Per la
sua
efficienza
e
rigore
metodologico,
l’algoritmo e’ stato integrato nel software piu’
diffuso al mondo per l’analisi dei dati da DNA.
Questo importante risultato scientifico porta la
firma di Daniel Taliun che oggi alla Libera
Universita’ di Bolzano ha discusso la tesi di
dottorato in informatica svolta presso il Centro di Biomedicina dell EURAC. Il DNA e’
composto da 3 miliardi di basi, cioe’ di lettere, e la sua sequenza e’ composta da segmenti
stabili alternati a punti di rottura. I segmenti stabili vengono sempre ereditati assieme come
un unico pezzo, mentre i punti di rottura sono quelli che portano alla variabilita’ del DNA tra
persone perche’ consentono a due sequenze successive di ricombinarsi in modo nuovo.
Riconoscere rapidamente i segmenti regolari e’ molto utile perche’ consente di
METEO
rappresentare il DNA in maniera meno complessa e di identificare con maggior precisione
e velocita’ le zone di DNA associate alle malattie. Un grande aiuto in questa direzione
arriva dal metodo sviluppato da Daniel Taliun presso il Centro di Biomedicina dell EURAC
in collaborazione con la Facolta’ di Scienze e Tecnologie informatiche dell Universita’ di
Bolzano.
Il
nuovo
algoritmo
permette
infatti
di
Previsioni Meteo, caldo estivo al centro/sud:
il bollettino dell’aeronautica militare per oggi
e domani [MAPPE]
processare l’intero DNA impiegando l’1 per
Cambiamenti climatici:
l’impegno delle città e
delle Regioni per
contribuire agli accordi
internazionali
cento del tempo rispetto alle tecniche finora
utilizzate: mentre un tempo erano necessari
20 giorni oggi bastano 5 ore. “La portata del
risultato
ha
suscitato
l’interesse
dei
E’ iniziata l’ondata di
super-caldo: oggi +39°C a
Oristano, adesso una
notte bollente [DATI-LIVE]
responsabili di PLINK, il maggior software a
livello mondiale per l’analisi di dati genetici, che ci hanno chiesto di poter integrare il nostro
algoritmo nel loro programma”, dichiara Cristian Pattaro, responsabile del gruppo di
biostatistica del Centro di Biomedicina dell EURAC e referente dello studio per la parte
legata a genetica e biostatistica. “Questo progetto collega matematica, informatica e
TECNOLOGIA
genetica e unisce le competenze dei due enti. Unibz ed EURAC hanno messo a
disposizione le loro specializzazioni per puntare a un traguardo di eccellenza che ci ha
reciprocamente portati al di la’ dei nostri usuali ambiti di studio”, spiega Johann Gamper,
docente della Facolta’ di Scienze e Tecnologie informatiche alla Libera Universita’ di
Bolzano e responsabile del dottorato di ricerca in Informatica. Il nuovo algoritmo trova
applicazione sia nell’analisi delle cause genetiche delle malattie, sia nella genetica delle
Terremoto in Nepal: dai satelliti italiani la
prima mappa dei danni
popolazioni. Per quanto riguarda le malattie, il riconoscimento di segmenti di DNA regolari
consente una maggior precisione nella ricerca delle variazioni genetiche associate alle
malattie, perche’ permette di circoscrivere l’area di ricerca a un segmento piu’ piccolo.
Ambiente: Solar Impulse 2
si prepara alla trasvolata
record sul Pacifico
Nella genetica delle popolazioni, invece, il riconoscimento di una successione di sequenze
regolari e punti di rottura da’ informazioni importanti per lo studio del background genetico,
perche’ si e’ visto che queste successioni sono abbastanza stabili all interno di una
Expo 2015: mel
supermercato del futuro
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con YuMi, il robot
collaborativo
popolazione, ma possono cambiare tra popolazioni diverse. Per la discussione della tesi di
dottorato Daniel Taliun e’ rientrato a Bolzano dagli Stati Uniti. “I risultati dello studio svolto
a Bolzano hanno avuto grande risonanza a livello internazionale e questo mi ha permesso
di ottenere un posto da ricercatore al dipartimento di Biostatistica dell Universita’ del
Michigan, uno dei piu’ rinomati centri al mondo”, conclude il neo-dottore di ricerca che per
finalizzare l’algoritmo ha inventato e dimostrato nuovi teoremi matematici.
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