Diapositiva 1 - Plurigentest

Test
Prenatale
Non
Invasivo
Benvenuti
State entrando nel percorso
NIPT,
test non invasivi di previsione
delle più frequenti malattie
genetiche
NIPT – PGT2
PGT1
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Numero casi
(nati + IVG)
6849333
207225
Prevalenza anomalie
congenite
2,37 % (1:42)
2,27 % (1:44)
Prevalenza anomalie
cromosomiche
0,35 % (1:270)
0,32 % (1:312)
cardiache
Alcune anomalie
cromosomiche e
sindromi
genetiche sono
causa di nascite
di bambini affetti
con una
frequenza fra
1/900 e 1/10000
nati
68,8
genito-urinarie
45
muscolo-schel
43,3
cromosomi
34,9
SNC
24,5
facciali
15,23
digestive
15,1
sindromi genetiche
5,85
0
20
40
60
80
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
La mappa dei 46
cromosomi
presenta i tre
che causano le
principali
anomalie
cromosomiche
compatibili con
la
sopravvivenza,
13, 18, 21
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Quando a una
coppia di
cromosomi
normalmente
presenti se ne
aggiunge un
terzo, avviene la
trisomia, causa
degli importanti
effetti clinici
associati
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
La trisomia si
forma da un
errore di
maturazione
dello
spermatozoo
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
o dell’ovocita
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
prima della
fecondazione
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
quando i 46
cromosomi di
ciascuno di essi
Y
X
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
si riducono a 23,
uno per coppia
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
per dar luogo,
unendosi, alla
prima cellula
fetale di 46
cromosomi
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Se la
suddivisione dei
cromosomi non
avviene
correttamente
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
in una cellula
della
fecondazione ci
sarà un
cromosoma in
più a causare la
trisomia
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Il test sul DNA
fetale nel plasma
materno
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Trisomie 13,
18, 21
può cercare la
presenza di
trisomie 13, 18 e
21
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Trisomie 13,
18, 21
mentre sul
liquido
amniotico si
studia il
cariotipo fetale
completo di rare
anomalie di
struttura
Analisi del
cariotipo
Con rare
anomalie di
struttura
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Il DNA fetale nel
sangue materno
NON identifica
dal 10% al 40%
delle anomalie
che rivela
l’amniocentesi,
secondo l’età
materna
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Il DNA fetale è
presente nel
sangue materno
a partire dalla 10
settimana e
deriva dalla
placenta che
perde le sue
cellule morte nel
sangue materno
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Il DNA placentare delle cellule nel sangue è
frammentato…
Fragment length
CGCTAGAAG
GAAGTCGCG
ATTTCCGCGATCTTCCCGTTCGACTGCAGACCTTCAGCGCGCATATATCGCTAGCATACCGTTATAC
 Human Genome 
Alignment
Fragment Size
2 x 36 bp
determination
…i frammenti vengono sequenziati……
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
#21 fragments Test chromosome
L’analisi dei
frammenti di
DNA identifica e
conta quelli di
origine
materna…
#21 fragments Reference chromosome
FetalcfDNA
MaternalcfDNA
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
#21 fragments Test chromosome
poi quelli fetali
che vengono
confrontati coi
valori normali di
riferimento
#21 fragments Reference chromosome
FetalcfDNA
MaternalcfDNA
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
#21 fragments Test chromosome
per valutare
l’eventuale
presenza di
valori
compatibili con
una trisomia
#21 fragments Reference chromosome
FetalcfDNA
MaternalcfDNA
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
~2% hanno insufficiente frazione fetale
<1% nostra rete ambulatoriale
Il test si effettua
con almeno il 24% di frazione
fetale a seconda
dei test, in caso
contrario si
ripete il prelievo
senza ulteriori
costi
Cases
1300
Successful 1st tier
1286
Successful 2nd tier
8
Low DNA
7
High variance
1
Double fail
4 outcome ok
Low DNA / FIV ovod.
1
High variance / obese
2
No repeat
2
Go to cvs > karyo ok
1
IUD
1
1/450
ritardi di consegna in laboratorio
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
La elaborazione
matematica
indica un
risultato di
basso rischio
compatibile con
assenza di
trisomia
Basso rischio trisomia
Compatibile con assenza di
trisomia
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
o di alto rischio
compatibile con
presenza di
trisomia che
necessita di
consulenza
genetica e
verifica con
tecnica invasiva
Alto rischio trisomia
Compatibile con presenza di
trisomia
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Trisomy
21
Trisomy
18
Trisomy 13
CVS trophoblast
False positive rate/specificity
0.08%
0.06%
0.2%
62000 cases*
False negative Population rate
False negative/sensitivity
0.02%
0.74%
0.01%
1.59%
NS
0.74%
NIPT total 2013-2015
False positive rate/specificity
0.09%
0.13%
0.13%
False negative Population rate
False neg. /detection rate
0.08%
0.8%
0.06-0.12%
3.7%
0.18-0.36%
9%
Le performances del test sono paragonabili a
quelle del trofoblasto dei villi coriali
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Trisomy
21
Trisomy
18
Trisomy 13
CVS trophoblast
False positive rate/specificity
0.08%
0.06%
0.2%
62000 cases*
False negative Population rate
False negative/sensitivity
0.02%
0.74%
0.01%
1.59%
NS
0.74%
NIPT total 2013-2015
False positive rate/specificity
0.09%
0.13%
0.13%
False negative Population rate
False neg. /detection rate
0.08%
0.8%
0.06-0.12%
3.7%
0.18-0.36%
9%
con sensibilità e specificità per la trisomia 21
superiori al 99%
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Trisomy
21
Trisomy
18
Trisomy 13
CVS trophoblast
False positive rate/specificity
0.08%
0.06%
0.2%
62000 cases*
False negative Population rate
False negative/sensitivity
0.02%
0.74%
0.01%
1.59%
NS
0.74%
NIPT total 2013-2015
False positive rate/specificity
0.09%
0.13%
0.13%
False negative Population rate
False neg. /detection rate
0.08%
0.8%
0.06-0.12%
3.7%
0.18-0.36%
9%
Le performances del test per tris. 13 e 18 sono
migliorate se associate a ecografie fra 11 e 20 sett.
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
T13,T18,T21 hanno maggior prevalenza col 70%
variabile con l’età, le anomalie XXX,XXY,XYY e
Anomalie
cromosomiche
‰ prevalenza
Totale
4,4
T21 T18 T13
3,1
70 (48<77)
X-Y trisomie
0,2
5
X0
0,33
8
Anomalie rare
%
17 (40<10)
45,X hanno il 13% mentre le anomalie rare
(delezioni e duplicazioni) il restante 17%
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Le anomalie rare sono di struttura dei cromosomi
e si indagano col cariotipo amniotico. Sul DNA
fetale
nel plasma
CA cases
‰ prevalenza
%
materno
esistono
Totale
4,4
alcune
Anomalie rare
17
tecniche di
studio del
genoma
non ancora
validate internazionalmente ma con performances
promettenti.
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Plurigentest1
studia alcune
sindromi
genetiche che
possono essere
prevenute con lo
studio del DNA
della gestante
che potrebbe
essere portatrice
sana della
malattia
Ricerca portatori malattie mendeliane
Fibrosi Cistica
portatori
Atrofia muscolare spinale
Sordità NS
Ritardo mentale FRAXA
1/25
1/50
1/35
1/260
1/2500
1/10000
3% popol
1/1250M 1/2000F
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Queste malattie
indicate sono
molto frequenti,
da 1/1250 a
1/10000 nati e,
nel caso anche il
partner sia
portatore, il feto
ha 25% di
probabilità di
essere malato.
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.
Questa presentazione non sostituisce la consulenza
specialistica associata alla esecuzione dei test
U/S
wit
hNT
NIPT
•
•
•
low risk NIPT
increased NT
abnormal US
10
11
HIGH RISK
12
•
•
•
13
ANATOMY
U/S
LOW RISK
•
high risk NIPT
increased NT
abnormal US
14
15
CVS
16
maternal choice
17
18
19
20
AMNIO
32
Property of
Lamberto Camurri Ph.D.