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METABOLISMO GLICOLISI E kREBS

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METABOLISMO GLICOLISI E kREBS
METABOLISMO
Il metabolismo è l’insieme delle reazioni biochimiche che regolano tutte le
attività degli esseri viventi (batteri, virus, piante e animali). Il metabolismo in
genere prevede la produzione e l’utilizzo dell’energia sottoforma di ATP.
Abbiamo due tipi di metabolismo: plastico ed energetico.
Quello plastico riguarda la demolizione delle proteine, utile per ottenere
amminoacidi liberi che vengono riutilizzati per costruire le strutture proteiche
specifiche per l’organismo.
Quello energetico prevede, invece, la demolizione degli zuccheri, lipidi e
proteine per produrre energia sottoforma di ATP. La demolizione degli
zuccheri produce all’incirca il 50-55% del fabbisogno energetico; i lipidi,
invece, producono all’incirca il 40-45% ed infine le proteine all’incirca il 5%.
Il metabolismo energetico infine viene diviso in :
-catabolismo: produzione di energia;
-anabolismo: consumo di energia.
Ad ogni reazione catabolica ne corrisponde una anabolica perché l’energia
viene prodotta soltanto quando viene richiesta dall’organismo.
Ricordiamo che in biochimica esistono due tipi di reazione:
-esoergoniche che avvengono con liberazione di energia;
-endoergoniche che avvengono con consumo di energia.
Metabolismo degli zuccheri
Gli zuccheri o carboidrati si possono trovare sottoforma di monosaccaridi
(fruttosio e glucosio) o polisaccaridi. Per poter effettuare il metabolismo degli
zuccheri e polisaccaridi devono essere ridotte a molecole semplici ad esempio:
l’amido viene demolito dall’amilasi in maltoso e il maltoso dalla maltasi in
glucosio libero.
Glicolisi
La glicolisi è il meccanismo che determina la demolizione del glucosio,
avviene nel citoplasma in assenza di ossigeno, si struttura in dieci reazioni le
prime delle quali sono anaboliche e servono per la fase di preparazione; le
ultime vengono definite fase di recupero durante la quale si producono
molecole di ATP
Ricordiamo la formula dell’ATP (nucleotide) è costituita da adenina, ribosio
e in posizione 5 da tre molecole di fosfato legati tra loro da ponti
fosfodiestere e quando cede il fosfato libera -30,5 KJ.
ATP
ADP + P ∆ G – 30,5 KJ
Ricordiamo che in biochimica esistono 2 tipi di reazione:
 esoergoniche, che avvengono con liberazione di energia,
 endoergoniche, che avvengono con consumo di energia.
Nel caso della prima tappa della glicolisi, osserviamo che quando il glucosio
in presenza di ATP si trasforma in glucosio 6 fosfato consuma 13.8 KJ, e il
ΔG finale è pari a -16.7 KJ.
L’α-glucopiranoso in presenza di ATP Mg++ e in presenza dell’enzima esochinasi
che
appartiene
al gruppo
delleditransferasi
(trasferisce
fosfato dall’ATP)si alla
Il glucosio
6 fosfato
in presenza
un altro enzima
chiamatoilfosfofruttoisomerasi
posizione
glucosio
trasformandolo in glucosio 6fosfato.
trasforma 6indel
fruttoso
6 fosfato.
LE 10 REAZIONI DELLA GLICOLISI
LA F ASE PREPARA TORIA
1. Fosforilazione del glucosio
Nel caso della prima tappa della glicolisi, osserviamo che quando il glucosio in
presenza di ATP si trasforma in glucosio 6 fosfato consuma 13.7 KJ, e il ΔG
finale è pari a -16.8 KJ.
2. Conversione del glucosio 6-fosfato in fruttosio 6-fosfato
PFK-1
3. Fosforilazione del fruttosio 6-fosfato in fruttosio 1,6-bisfosfato
Fosfofruttochinasi-2 (PFK-2) catalizza la formazione di fruttosio 2,6-bisfosfato da fruttosio 6fosfato
Biochimica
metabolismo glicidico - catabolismo
12
4. Scissione del fruttosio 1,6-bisfosfato
Biochimica
metabolismo glicidico - catabolismo
13
Come
si vede l’aldolasi ha prodotto il 96% di diidrossi-acetonefosfato e il 4% di
gliceraldeide 3 fosfato. Il diidrossiacetone rappresenta infatti una sorta di
molecola di riserva utile al momento della richiesta di energia da parte
dell’ATP. Quando avviene questa richiesta il diidrossiacetone fosfato si
trasforma, in presenza della treosoisomerasi in gliceraldeide 3 fosfato.
5. Interconversione dei triosi fosfati
Biochimic a
metabolis mo gli cidi co - c ata bol ismo
14
LA FASE DI RECUPERO DELLA GLICOLISI
Domandina:
Quale è il G°’ della completa defosforilazione
Dell’1,3-Bisfosfoglicerato?
(G°’ di idrolisi = -49 kJ/mole)
6. Ossidazione della gliceraldeide 3-fosfato a 1,3-bisfosfoglicerato
Questa è l’unica reazione ossidativa della glicolisi anaerobia. In tale reazione “chiave” si
genera una molecola “super-energetica”.
Biochimic a
16
meta boli smo glicidi co - c atabol ismo
Questa è l’unica reazione ossidata della glicolisi anaerobica. In tale reazione
“chiave” si forma una molecola “super energetica”. Una volta completata la
fase preparatoria della glicolisi dove sono state consumate due molecole di
ATP, inizia la cosiddetta fase di recupero dove la gliceraldeide 3 fosfato in
presenza dello ione fosfato, del Nad+ Ox e dell’enzima gliceraldeide 3 fosfato
deidrogenasi che cattura due idrogeni e si trasforma in 1,3 difosfoglicerato.
L’1,3 difosfoglicerato nella reazione successiva cede il fosfato con un ΔG pari
a -49 KJ. Possiamo vedere che questa molecola possiede un contenuto
energetico decisamente maggiore dell’ATP dove la liberazione del fosfato mi
liberava 30,5 KJ.
7. Tras fe rime nto del gruppo fosforico da ll’1,3- bis fosfoglicerat o all’ ADP .
Bio chim ic a
m e tab o lis mo g li cid i co - c ata b ol ism o
20
Ogni qualvolta il Nad+Ox cattura due idrogeni trasformandosi in NadH+H+ ridotto
libera una quantità di energia necessaria alla produzione di 2,5 molecole di ATP.
8. Conversione del 3-fosfoglicerato in 2-fosfoglicerato.
Biochimica
21
metabolis mo gli cidi co - catabol ismo
Il 2 fosfoglicerato si trasforma in fosfoenolpiruvato in presenza dell’enzima enolasi
che determina l’eliminazione di una molecola d’acqua con un ΔG d’idrolisi uguale a 62 KJ/mol.
(G°’ di idrolisi = -62 kJ/mole)
9. Deidratazione del 2-fosfoglicerato a fosfoenolpiruvato.
Il fosfoenolpiruvato è un’altra molecola super-energetica
Bio chimica
metabo lis mo gli cidi co - c atabol ismo
23
Il fosfoenolpiruvato è un’altra molecola super energetica.
10. Trasferimento del gruppo fosforico dal fosfoenolpiruvato all’ADP.
Rispondere: quale è stata la variazione di energia libera dell’intero processo?
E quale è il suo significato?
Bio chimic a
24
metabolis mo gli cidi co - catabol ismo
Biochimica
metabolismo glicidico - catabolismo
25
Bilancio energetico della glicolisi
Totale bilancio
LE VARIAZIONI ENERGETICHE NEL CORSO DELLA GLICOLISI
Reazione
DG DG +
____________________________________________________
1
2
3
4
5
6 (x2)
7 (x2)
8 (x2)
9 (x2)
10 (x2)
16,7
Totali
Bilancio
130,7
61,3
1,7
14,2
23,8
7,5
12,6
37
8,8
15
62,8
69,4
CICLO di KREBS
LA DECARBOSSILAZIONE OSSIDATIVA DEL PIRUVATO
Il piruvato prodotto nella glicolisi attraversa le membrane mitocondriali e si porta nella
matrice, dove viene trasformato in acetil-coenzima A (acetil-CoA) nel processo che
prende il nome di decarbossilazione ossidativa del piruvato.
Bioc himic a
Met abolismo intermedio
16
L’acetilCoA, destinato nel catabolismo alla sua completa ossidazione, può
formarsi anche dalla ossidazione degli acidi grassi. Si noti che l’acido grasso
viene sintetizzato a partire da acetilCoA
Il ciclo dell’acido citrico (scoperto da Hans Krebs) si compone di otto reazioni
Bioc himic a
Met abolismo i ntermedi o
1. Condensazione dell’acetil-CoA con l’ossalacetato
23
2. Formazione dell’isocitrato
3. Ossidazione dell’isocitrato a -chetoglutarato
4. Ossidazione dell’-chetoglutarato a succinil-CoA e CO2
5. Conversione del succinil-CoA a succinato
6. Ossidazione di succinato a fumarato
7. Idratazione di fumarato a malato
8. Ossidazione di malato a ossalacetato
VIE ANFIBOLICHE e ANAPLEROTICHE del CICLO di KREBS
PERCHE’ L’OSSIDAZIONE DELL’ACETATO E’ COSI’ COMPLICATA?
Con l a su a na tura spic catam ente a nfibolica, il cicl o dell’acido c itrico è il cuo re del m eta bolismo
intermedio. Le rea zio ni evidenziate in rosso servo no per rei ntegrare il cic lo dei s uoi intermedi,
sottratti per so sten ere l e sintesi. Ta li rea zio ni si dico no ana plerotiche.
Biochimica
Met abolismo i ntermedi o
41
**
**Il numero di moli di ATP diventa 3 6-3 8 se si calcolano 3 ATP per NADH e 2 ATP per F ADH 2
36 ATP x 30,5 kJ/mole = 1098 kJ/mole: poiché l’ossidazione completa di una mole
di glucosio libera 2840 kJ/mole, significa una resa del 38%
Biochimic a
Met abo lismo i ntermedi o
40
MITOCONDRI E FOSFORILAZIONE OSSIDATIVA
Il mitocondrio è un organulo cellulare di forma generalmente allungata, presente
in tutti gli Eucarioti (con alcune eccezioni). I mitocondri sono organuli presenti
nel citoplasma di tutte le cellule animali e vegetali a metabolismo aerobio.
Mancano solo nelle cellule procariotiche, cioè i batteri, dove le funzioni
respiratorie vengono espletate da proteine enzimatiche contenute nella
membrana cellulare e nelle sue invaginazioni, dette mesosomi. I mitocondri sono
gli organelli addetti alla respirazione cellulare, costituiti da sacchette contenenti
enzimi respiratori. Sono costituiti da due membrane: la membrana interna e la
membrane esterna; lo spazio fra queste due membrane è detto spazio
intermembrana. Lo spazio delimitato dalla membrana interna è detto matrice
mitocondriale; la membrana interna si estende nella matrice formando delle
pieghe dette creste mitocondriali, dove si concentrano gli enzimi respiratori.
Il mitocondrio, isolato dalla struttura cellulare che lo circonda, assume una
forma che ricorda quella di un salsicciotto ed è lungo 1-4 µm ed ha un diametro
di 0,2-1 µm. Nella cellula, esso assume una forma piu complessa; ad esempio
nelle piante (Arabidopsis thaliana) e nel lievito (Saccharomyces cerevisiae) è
piu opportuno parlare di una rete mitocondriale in cui i mitocondri vanno
incontro a fissione e fusione.È delimitato da una doppia membrana: quella
esterna permette il passaggio di piccole molecole, quella interna è selettivamente
permeabile e ripiegata in estroflessioni chiamate creste mitocondriali che ne
aumentano la superficie.
Le due membrane identificano due differenti regioni: lo spazio intermembrana,
quello delimitato dalla membrana esterna e quella interna, e la matrice,
circoscritto dalla membrana interna.
Le due membrane mitocondriali presentano differenti proprietà a causa della loro
diversa composizione.
La membrana esterna è composta per il 50% di lipidi e per il resto presenta
svariati enzimi dalle molteplici attività tra cui: l'ossidazione dell'adrenalina,
l'allungamento degli acidi grassi e la degradazione del triptofano. Essa, inoltre,
contiene porine: canali proteici transmembrana, fomati per lo più da foglietti β,
non selettivi. Ciò fa sì che la membrana esterna sia assai permeabile e permetta il
passaggio di molecole di massa fino a 5000 Dalton. Quest'elevata permeabilità
era già nota all'inizio del XX secolo allorché venne notato il rigonfiamento cui i
mitocondri vanno soggetti a seguito della loro immersione in una soluzione
ipotonica.
La membrana interna ha un rapporto proteine/lipidi che si aggira su 3:1 (che
significa che per ogni 15 proteine vi è un fosfolipide) e contiene più di 100
molecole polipeptidiche. Un'altra caratteristica particolare, in quanto propria
delle membrane batteriche, è la presenza di molecole di cardiolipina
(difosfatidil-glicerolo) e l'assenza di colesterolo.
La membrana interna, contrariamente a quella esterna, è assai impermeabile, in
quanto priva di porine, ma possedente trasportatori transmembrana altamente
selettivi per ogni molecola o ione.
A seguito di ciò le due facce della membrana interna vengono chiamate,
rispettivamente, versante della matrice e versante citosolico (in quanto viene
facilmente raggiunto dalle piccole molecole del citosol cellulare) oppure
versante N e versante P in ragione del diverso potenziale di membrana (neutro
nel versante citosolico e positivo nello spazio intermembranoso interno).
La matrice mitocondriale
La matrice mitocondriale ha consistenza gelatinosa a causa della concentrazione
elevata di proteine idrosolubili (circa 500 mg/ml). Essa contiene, infatti,
numerosi enzimi, ribosomi (più piccoli di quelli presenti nel resto della cellula) e
molecole di DNA circolare a doppio filamento.
Il genoma mitocondriale
Il genoma mitocondriale contiene 16569 coppie di basi e possiede 37 geni
codificanti per due RNA ribosomiali (rRNA), 22 RNA di trasporto (tRNA) e 13
proteine che fanno parte dei complessi enzimatici deputati alla fosforilazione
ossidativa. È da notare, comunque, che il numero di geni presenti sul DNA
mitocondriale è variabile a seconda delle specie.
In ogni mitocondrio si trovano da due a dieci copie del genoma.
Il resto delle proteine presenti nel mitocondrio deriva da geni nucleari i cui
prodotti vengono appositamente trasportati. Le proteine destinate al mitocondrio
generalmente vengono riconosciute grazie ad una sequenza leader presente sulla
loro parte N-terminale. Tale sequenza contiene da 20 a 90 amminoacidi, di cui
nessuno carico negativamente, con all'interno alcuni motivi ricorrenti, e sembra
che abbia un'elevata possibilità di dare origine ad una α-elica anfipatica.
Circa 28 dei geni mitocondriali (2 rRNA, 14 tRNA e 12 proteine) sono codificati
su uno dei due filamenti di DNA (detto H, da heavy strand) mentre i rimanenti
geni (8 tRNA e 1 proteina) sono codificati sul filamento complementare (detto
L, da light strand).
La presenza della catena di trasporto degli elettroni con la sua capacità di
produrre radicali liberi, la mancanza di istoni ed i limitati sistemi di riparo,
rendono il DNA mitocondriale facilmente danneggiabile ed in effetti il suo tasso
di mutazione è circa dieci volte maggiore di quello nucleare. Ciò fa sì che si
possano avere sequenza mitocondriali differenti anche all'interno di uno stesso
individuo.
La presenza di ribosomi permette al mitocondrio di svolgere una propria sintesi
proteica.
Una particolarità del codice genetico mitocondriale sta nel fatto che esso è
leggermente diverso da quello comunemente noto. Il codone UGA,
normalemente codone di stop, codifica per il triptofano. I vertebrati, inoltre,
usano la sequenza AUA (e l'uomo anche AUU) per codificare la metionina (e
non l'isoleucina) mentre AGA ed AGG funzionano come codoni di stop. Si è
visto, inoltre, che tra specie diverse vi possono essere differenze nel codice
mitocondriale che, di conseguenza, non è uguale per tutti.
Il DNA mitocondriale umano viene ereditato per via matrilineare (eredità non
mendeliana) in quanto durante il processo di fecondazione i mitocondri dello
spermatozoo sono marcati con ubiquitina, una proteina che si lega ad altre
proteine che devono essere degradate. In conseguenza di ciò, il genoma
mitocondriale della prole sarà quasi uguale a quello materno (fatte salve
eventuali mutazioni) ed, inoltre, se la madre è affetta da una malattia a
trasmissione mitocondriale, la erediteranno tutti i figli, mentre se ne è affetto il
padre, non la erediterà nessuno. In letteratura sono riportati rarissimi casi in cui
il DNA mitocondriale sembra derivare dal padre o da entrambi i genitori
Le funzioni del mitocondrio
Il mitocondrio è in grado di svolgere molteplici funzioni. La più importante tra
esse consiste nell'estrarre energia dai substrati organici che gli arrivano per
produrre un gradiente ionico che viene sfruttato per produrre adenosintrifosfato
(ATP). Gli altri processi in cui il mitocondrio interviene sono:






l'apoptosi e la morte neuronale da tossicità da glutammato,
regolazione del ciclo cellulare,
regolazione dello stato redox della cellula,
sintesi dell'eme,
sintesi del colesterolo,
produzione di calore.
La produzione di energia
È la funzione principale del mitocondrio e viene svolta utilizzando i principali
prodotti della glicolisi: il piruvato ed il NADH. Essi vengono sfruttati in due
processi: il ciclo di Krebs e la fosforilazione ossidativa.
Il ciclo di Krebs
Le molecole di piruvato prodotte dalla glicolisi vengono trasportate all'interno
della matrice mitocondriale dove vengono decarbossilate per formare gruppi
acetili che vengono coniugati con il Coenzima A (CoA) per formare acetilCoA.
Il tutto viene catalizzato dalla piruvato deidrogenasi: un grosso complesso
multienzimatico. Successivamente l'acetilCoA viene immesso nel ciclo di Krebs
o ciclo degli acidi tricarbossilici o ciclo dell'acido citrico che permette di
generare 3 molecole di NADH ed una di FADH2 secondo la seguente reazione
generale:
AcetilCoA + 2 H2O + FAD + 3 NAD+ + GDP + Pi → 2 CO2 + FADH2 + 3
NADH + 3 H+ + GTP + HS-CoA
Tutti gli enzimi del ciclo di Krebs si trovano liberi nella matrice, fatta esclusione
per il complesso della succinato deidrogenasi che è legata alla membrana
mitocondriale interna nel versante N.
Fosforilazione ossidativa: la catena di trasporto degli elettroni
Vengono utilizzati sia il NADH che il FADH2 prodotti dalla glicolisi e dal ciclo
di Krebs. Attraverso un complesso multienzimatico avente le funzioni di catena
di trasporto gli elettroni vengono prelevati da NADH e FADH2 e, dopo una serie
di passaggi intermedi, vengono ceduti all'ossigeno molecolare (O2) che viene
ridotto ad acqua. Durante il trasferimento elettronico le varie proteine
trasportatrici subiscono dei cambiamenti conformazionali che consentono di
trasferire dei protoni dalla matrice allo spazio intermembrana contro un
gradiente di concentrazione.
Nel mitocondrio si possono isolare ben quattro complessi poliproteici
responsabili del trasporto degli elettroni:
 Complesso I (NADH
deidrogenasi)
che
contiene almeno 30
diversi polipeptidi, una
flavoproteina e 9 centri
ferro-zolfo e per ogni
coppia di elettroni fatta
passare
vengono
trasferiti tre o quattro
protoni,
 Complesso
II
(Succinato
deidrogenasi) che, oltre
a
catalizzare
una
reazione del ciclo di
Krebs,
consente
il
trasferimento di elettroni al FAD ed all'ubichinone ma non permette il
passaggio di protoni,
 Complesso III (Citocromo C riduttasi) che contiene circa 10 polipeptidi e
gruppi eme ed un centro ferro-zolfo, permette il passaggio di elettroni
dall'ubichinone ridotto al citocromo c e per ogni coppia di elettroni
trasferisce quattro protoni,
 Complesso IV (Citocromo c ossidasi) che contiene almeno 13 polipeptidi
permette il trasferimento di elettroni dal citocromo c all'ossigeno ed anche
lo spostamento dei protoni anche se non ne è ben chiaro il numero (forse
quattro per ossigeno ridotto).
Successivamente i protoni vengono rifatti passare attraverso la membrana
interna, in un processo di diffusione facilitata, tramite l'enzima ATP sintetasi che
ottiene così l'energia sufficiente per produrre molecole di ATP, trasferendo un
gruppo fosfato a dell'ADP. Si è visto che una coppia di elettroni, prelevati da
NADH, è in grado di rilasciare un quantitativo d'energia sufficiente a produrre
tre molecole di ATP mentre con una coppia elettronica ottenuta dal FADH2 se ne
ottengono due.
Sia la glicolisi che la fosforilazione ossidativa permettono di ottenere ben
trentotto molecole di ATP per ogni glucosio utilizzato (anche se questo valore
può anche variare a seconda del rapporto [ATP]/[ADP] intracellulare).
L'importanza del trasferimento dei protoni attraverso la membrana mitocondriale
interna nella sintesi di ATP, meccanismo definito chemioosmotico, venne
individuato nel 1961 da Peter Mitchell il quale ottenne, per questo, il premio
Nobel per la chimica nel 1978. Nel 1997 a Paul D. Boyer e John E. Walker
venne consegnato le stesso premio per aver chiarito il meccanismo d'azione della
ATP sintetasi
Mitocondrio e l'apoptosi
Il mitocondrio funziona da centrale d'integrazione degli stimoli apoptotici. Essi
possono essere di molteplice natura (caspasi, ceramide, vari tipi di chinasi,
ganglioside GD3, ecc...) e sono in grado di determinare l'apertura di un
complesso poliproteico chiamato poro di transizione mitocondriale (Permeability
Transition Pore Complex, PTPC) localizzato in alcuni punti di contatto tra le due
membrane mitocondriali. Quest'evento che fa cadere la differenza di potenziale,
per uscita dei protoni, ed ingresso di molecole prima interdette all'ingresso.
Come risultato finale, il mitocondrio si riempe di liquido e la membrana esterna
scoppia liberando nel citoplasma fattori stimolanti l'apoptosi come AIF,
(Apoptosis Inducing Factor) che è in grado di raggiungere il nucleo ed attiva una
via indipendente dalle caspasi in grado di degradare il DNA, ed il citocromo c
che si lega alle proteine Apaf-1 (apoptotic protease activating factor) e caspasi 9
ed una molecola di ATP formando un complesso definito apoptosoma. La
caspasi 9 presente diviene in grado di attivare altre caspasi che danno il via ad
una cascata molecolare che si conclude con la degradazione del DNA ad opera
di fattori nucleari e conseguente morte cellulare (è tipico delle cellule
dell’endometrio)
La sintesi dell'eme
La sintesi delle porfirine è un processo enzimatico altamente conservato che
nell'uomo determina la sintesi del gruppo eme mentre in altri organismi serve
anche a produrre composti strutturalmente simili, come la cobalamina, le clorine
e le batterioclorine. All'interno del mitocondrio avvengono parte delle reazioni
che portano alla sintesi dell'eme che poi viene portato fuori nel citoplasma dove
viene coniugato con le catene polipeptidiche.
La sintesi del colesterolo
La sintesi del colesterolo è un fenomeno che avviene a livello del citoplasma
cellulare e che parte con l'acetilCoA il quale viene prodotto a livello
mitocondriale durante il ciclo di Krebs.
La produzione di calore
Alcuni composti sono in grado di creare un disaccoppiamento tra il gradiente
protonico e la sintesi di ATP. Ciò avviene in quanto hanno la capacità di
trasporatare essi stessi i protoni attraverso la membrana mitocondriale interna. Il
disaccoppiamento creatosi aumenta il consumo di ossigeno e la velocità con cui
il NADH si ossida. Questi composti hanno permesso di indagare meglio sulla
fosforilazione ossidativa ed hanno anche permesso di capire che il fenomeno del
disaccoppiamento ha la funzione di produrre calore, in diverse condizioni, al fine
di mantenere costante la temperatura corporea: in animali in letargo, cuccioli
appena nati (tra cui anche l'uomo) ed in mammiferi che si sono adattati ai climi
freddi.Il disaccoppiamento avviene in un tessuto specializzato: il tessuto adiposo
bruno. Esso è, infatti, ricco di una proteina disaccoppiante chiamata
termogenina, formata da due subunità, che ha la capacità di formare una via in
cui i protoni possono transitare per entrare nella matrice mitocondriale e ciò
determina produzione di calore. Questo fenomeno è attivato dalla presenza di
acidi grassi che vengono liberati, in risposta a segnali ormonali, dai trigliceridi
cui si trovano attaccati.
Analisi del DNA mitocondriale
Vista la matrilinearità dell'ereditarietà del genoma mitocondriale, i genetisti e gli
antropologi hanno utilizzato il DNA del mitocondrio in studi di genetica delle
popolazioni e d'evoluzionistica ma esso viene anche impiegato nel campo delle
scienze forensi specie in casi in cui il materiale biologico sia molto degradato.
L'analisi del DNA del mitocondrio permette di far luce sui gradi di parentela,
sulle migrazioni e discendenze delle popolazioni e può venir usato anche per
dirimere casi di determinazione del sesso.
L'origine del mitocondrio: la teoria endosimbiotica
Come si è visto precedentemente, il mitocondrio presenta alcune caratteristiche
tipiche dei batteri: presenza di molecole di cardiolipina ed assenza di colesterolo
nella membrana interna, la presenza di un DNA circolare a doppia elica e la
presenza di ribosomi propri e di una doppia membrana. Come i batteri, i
mitocondri non hanno istoni ed i loro ribosomi sono sensibili ad alcuni
antibiotici (come il cloramfenicolo). In più i mitocondri sono organelli
semiautonomi in quanto replicano, per scissione binaria, autonomamente rispetto
alla cellula.
Stante queste similitudini, la teoria endosimbiotica afferma che i mitocondri
deriverebbero da ancestrali batteri, dotati di metabolismo ossidativo, che
sarebbero stati inglobati dalle cellule eucariote con conseguente mutuo
beneficio. Successivamente i batteri avrebbero trasferito gran parte del loro
materiale genetico a quello cellulare, divenendo così, mitocondri.
Dopo traumi, mitocondri scambiati per batteri e attaccati da sistema immunitario
Sono i mitocondri i responsabili delle
infiammazioni che seguono agli
infortuni. Lo afferma uno studio del
Beth Israel Deaconess Medical Center
(Bidmc) pubblicato dalla rivista
Nature. Secondo lo studio, in caso di
trauma i mitocondri, le “fabbriche di
energia” del corpo umano, vengono
rilasciati nel sangue, e vengono
attaccati dal sistema immunitario
perche’ scambiati per batteri. Per
testare l’ipotesi i ricercatori hanno
prima di tutto cercato il DNA mitocondriale nel sangue di un gran numero di
pazienti, trovando livelli anche migliaia di volte maggiori del normale.
Con degli altri esperimenti, tra cui l’iniezione di mitocondri nel sangue di cavie,
che hanno sviluppato infiammazioni, i biologi hanno dimostrato che proprio la
presenza di questi e’ la causa della risposta immunitaria. “Questo studio
suggerisce che i mitocondri assomigliano abbastanza ai batteri da suscitare una
risposta immunitaria – hanno affermato i ricercatori nell’articolo – questo
lavoro, oltre ad aver scoperto dettagli sconosciuti sulla risposta dell’organismo
umano ai traumi, puo’ dare vita a nuove strategie contro la sepsi. Quella che
viene trattata come un’infezione batterica, infatti, potrebbe essere invece causata
dai mitocondri”.
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