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6. Genetica mendeliana File
Genetica mendeliana •fattori = geni •eredità di tipo mendeliano = 1 gene • Mendel non conosceva i geni, ma stabilì le regole dell’ereditarietà • L’eredità di tipo mendeliano è rara: spesso un fenotipo dipende dall’interazione di più geni Paolo Edomi - Genetica Il modello di Mendel Pisum sativum • reperimento • n. progenie • t generazione autofecondazione fecondazione incrociata linee pure 7 caratteri Paolo Edomi - Genetica Genotipo e fenotipo • genotipo = insieme di geni (fattori) che determinano un carattere • fenotipo = manifestazione (espressione) del carattere caso più semplice: 1 genotipo 1 gene : 2 alleli 1 fenotipo 1 carattere Paolo Edomi - Genetica Omozigote ed eterozigote A: allele dominante a: allele recessivo AA = omozigote dominante aa = omozigote recessivo Aa = eterozigote Paolo Edomi - Genetica Legge della dominanza “Il carattere espresso in F1 è quello dominante” Se sono presenti entrambi gli alleli (eterozigote) si manifesta solo uno dei due (dominante); l’altro è recessivo Paolo Edomi - Genetica Simbologia genetica mendeliana A a A1, a2 Aa Bb dominante recessivo alleli genotipo Drosophila locus white w+ bw1, bw2, bwD (dominante) w+ w oppure + w gene w selvatico (wild type) alleli genotipo Paolo Edomi - Genetica Incrocio monoibrido • 1 carattere: definito da 2 alleli • P (parentale): linee pure • F1 (filiale 1): unico genotipo e fenotipo • F2: il carattere a ricompare (eredità particolata) rapporto fenotipico 3:1 Paolo Edomi - Genetica Incrocio diibrido • 2 caratteri: definiti da 2 coppie alleliche • P: linee pure • F1: unico fenotipo per ciascun carattere • F2: rapporto fenotipico 9:3:3:1 Paolo Edomi - Genetica Le leggi di Mendel Legge della segregazione “I due membri (alleli) di una coppia di geni segregano in meiosi in modo che il 50% dei gameti possiede un membro della coppia” 1 gamete: 1 allele Legge dell’assortimento indipendente “Nella meiosi la segregazione di ogni coppia di alleli è indipendente dalle altre” eccezione: il linkage Paolo Edomi - Genetica Eredità di geni autosomici indipendenti A A A B a a a b A a B b A a b B Paolo Edomi - Genetica Gameti nell’incrocio monoibrido rapporto genotipico 1:2:1 1 gamete: 1 allele AA, aa: 1 tipo di gameti Aa: 2 tipi di gameti Paolo Edomi - Genetica Gameti nell’incrocio diibrido gameti P: 1 tipo gameti F1: 4 tipi incrocio tra gameti: ¼ x ¼ = 1/16 rapporto genotipico 1:1:2:2:4:2:2:1:1 Paolo Edomi - Genetica Teoria cromosomica dell’eredità I geni si comportano come cromosomi • I geni sono a coppie come i cromosomi omologhi • 1a legge: conseguenza della separazione degli omologhi (singola meiosi) • 2a legge: conseguenza dell’indipendenza dei geni situati su cromosomi diversi (conteggio di molte meiosi) Paolo Edomi - Genetica Classi fenotipiche e genotipiche Paolo Edomi - Genetica Reincrocio (test cross) reincrocio dell’eterozigote con l’omozigote recessivo nella progenie si vede il prodotto dei gameti dell’individuo reincrociato (es: eterozigote) mediante il reincrocio è possibile determinare il genotipo della parentale con fenotipo dominante Paolo Edomi - Genetica Reincrocio a un carattere reincrocio dell’eterozigote con l’omozigote recessivo • in un reincrocio dell’eterozigote per un carattere il rapporto fenotipico è 1:1 Paolo Edomi - Genetica Reincrocio a due caratteri • reincrocio dell’eterozigote con il doppio omozigote recessivo • in un reincrocio dell’eterozigote per due caratteri il rapporto fenotipico è 1:1:1:1 Paolo Edomi - Genetica Calcolo di rapporti genetici • quadrato di Punnet • diagrammi ramificati • regole della probabilità Paolo Edomi - Genetica Quadrato di Punnet Paolo Edomi - Genetica Quadrato di Punnet per un incrocio a due caratteri Paolo Edomi - Genetica Diagrammi ramificati Costruzione di diagrammi ramificati per gameti: 1. individuare la percentuale di gameti di un genitore 2. per ciascun gamete indicare la percentuale di gameti dell’altro genitore 3. moltiplicare ogni singola percentuale di ciascun ramo del diagramma Paolo Edomi - Genetica Diagramma ramificato per un incrocio diibrido Costruzione di diagrammi ramificati per fenotipi: calcolo della F2 di un incrocio diibrido 1. indicare il rapporto fenotipico per un carattere 2. per ciascun fenotipo indicare il rapporto fenotipico dell’altro carattere 3. moltiplicare ogni singolo rapporto di ciascun ramo del diagramma Paolo Edomi - Genetica Diagramma ramificato per un incrocio triibrido calcolo della F2 di un incrocio triibrido considerare sempre indipendente il comportamento di ciascuna coppia di alleli Paolo Edomi - Genetica Calcolo delle PROBABILITÁ applicato alla genetica n. casi favorevoli probabilitá = Es. n. casi totali n. individui con dato fenotipo pfenotipo = n. individui totali p: compreso tra 0 e 1 più grande è il campione minore è l’errore di campionamento casuale Paolo Edomi - Genetica Regola del prodotto probabilitá composta la probabilità che accadano due o più eventi INDIPENDENTI è uguale al prodotto delle singole probabilitá Es1: Aa Bb x Aa Bb p (individuo Aa) = ½ p (individuo Bb) = ½ Es2: p (individuo AaBb) = ½ x ½ Aa Bb Cc Dd x Aa Bb Cc Dd p (AA bb Cc DD) = ¼ x ¼ x ½ x ¼ Paolo Edomi - Genetica Genotipi per caratteri indipendenti La probabilità di un genotipo per caratteri indipendenti è il prodotto delle probabilitá del genotipo di ciascun carattere p(genotipo n caratteri) = Πn p(genotipo n) Esempio: Aa Bb Cc Dd Ee Ff x Aa Bb Cc Dd Ee Ff p(AA bb Cc DD ee Ff) = ¼ x ¼ x ½ x ¼ x ¼ x ½ Paolo Edomi - Genetica Regola della somma probabilitá totale la probabilità che accadano due o più eventi mutuamente ESCLUSIVI è uguale alla somma delle singole probabilitá Es: Aa Bb x Aa Bb p (individuo A-B- oppure aabb) ? p (individuo A-B-) = 9/16 p (individuo aabb) = 1/16 p (individuo A-B- oppure aabb) = 9/16 + 1/16 = 10/16 Paolo Edomi - Genetica Teorema binomiale per calcolare la probabilitá di una combinazione di eventi alternativi (numero di eventi definiti) sviluppo di un binomio (a+b)n = 1 Paolo Edomi - Genetica Formula binomiale p= n! s!t! n = s+t as bt n! coefficiente binomiale s!t! n = numero di eventi s = n. di eventi di tipo a t = n. di eventi di tipo b a = probabilità di eventi di tipo a b = probabilità di eventi di tipo b Paolo Edomi - Genetica Es: probabilitá di avere 2 figli maschi su 5 1. calcolare le singole probabilità a=½ b=½ 2. determinare il numero degli eventi s=2 t=3 n = 2+3 = 5 • applicare la formula 5! p= ½2½3 2!3! Paolo Edomi - Genetica Test del chi quadrato (χ2) deviazioni casuali verifica di un’ipotesi ipotesi nulla: non c’è differenza reale tra i valori osservati ed attesi rifiutata (deviazioni NON casuali) o non rifiutata => bontá dell’adattamento tra dati attesi (e) e osservati (o) Paolo Edomi - Genetica Calcolo del χ2 1. 2. 3. 4. formulare un’ipotesi calcolare i valori attesi applicare la formula del chi quadrato interpretare il risultato Paolo Edomi - Genetica Incrocio monoibrido: calcolo del χ2 Paolo Edomi - Genetica Incrocio diibrido: calcolo del χ2 Paolo Edomi - Genetica χ2 g.l. = gradi di libertà = n. classi - 1 probabilitá Paolo Edomi - Genetica p = probabilitá che le deviazioni siano casuali p = 0,05 livello di significatività χ2= 3,84 per g.l. =1 p = 0,01 altamente significativo χ2= 6,64 per g.l. =1 p < 0,05 => RIFIUTO L’IPOTESI NULLA p > 0,05 => NON RIFIUTO L’IPOTESI NULLA χ2 p Paolo Edomi - Genetica